Le coût de construction d'un entrepôt est variable en fonction du projet. Celui-ci doit donc être clairement défini, ce qui est généralement le cas lorsqu'un chef d'entreprise décide de construire un entrepôt pour répondre à une demande précise. Dans le cas où la décision de construire un entrepôt est prise dans le cadre plus vague de l'anticipation d'un besoin, une étude de marché est alors nécessaire.

C'est au maître d'ouvrage que revient l'élaboration du programme proposant plusieurs solutions et leur approche financière. Ce programme mettra en évidence les caractéristiques techniques : l'organisation, le fonctionnement, le dimensionnement des surfaces, les raccordements au réseau, les conditions d'exploitation, les installations liées à la sécurité incendie. 

Une fois le programme défini, le maître d'ouvrage désignera un maître d'œuvre ou contractant général pour aborder la conception de l'ouvrage et, dans le même temps, un bureau de contrôle pour aborder les questions de sécurité. Ensemble, ils réaliseront alors une étude de faisabilité et un avant-projet présentant les différentes solutions répondant aux impératifs techniques et financiers du programme.
C'est à ce stade qu'une étude de sol sera réalisée en vu de déterminer le type de fondations nécessaires, et un premier planning prévisionnel de réalisation du projet sera établi.

Une fois la solution retenue, le maître d'oeuvre ou le contractant général doit procéder aux différentes demandes d'autorisations : permis de construire, demande de raccordement aux différents réseaux et dépôt éventuel de dossier d'obtention d'autorisation d'exploiter.
 

Les principaux éléments du coût de construction sont :

- l'acquisition du terrain et son aménagement ;
- la construction du bâtiment ;
- la mise en conformité du bâtiment.